Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab20P35295 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab20P35295 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms