Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rab5cP35278 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab5cP35278 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab5cP35278 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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