Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pola1P33609 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola1P33609 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pola1P33609 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pola1P33609 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pola1P33609 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pola1P33609 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pola1P33609 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pola1P33609 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pola1P33609 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola1P33609 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pola1P33609 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pola1P33609 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms