Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nedd1P33215 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd1P33215 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms