Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprmP28828 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprmP28828 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprmP28828 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprmP28828 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprmP28828 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprmP28828 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms