Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tgfb2P27090 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgfb2P27090 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms