Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms