Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CftrP26361 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CftrP26361 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CftrP26361 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CftrP26361 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CftrP26361 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CftrP26361 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CftrP26361 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CftrP26361 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CftrP26361 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CftrP26361 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CftrP26361 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CftrP26361 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CftrP26361 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CftrP26361 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CftrP26361 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CftrP26361 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CftrP26361 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CftrP26361 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CftrP26361 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CftrP26361 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CftrP26361 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CftrP26361 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CftrP26361 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CftrP26361 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CftrP26361 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CftrP26361 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CftrP26361 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CftrP26361 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CftrP26361 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CftrP26361 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
CftrP26361 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CftrP26361 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CftrP26361 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CftrP26361 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CftrP26361 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CftrP26361 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CftrP26361 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CftrP26361 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CftrP26361 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CftrP26361 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CftrP26361 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CftrP26361 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CftrP26361 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CftrP26361 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CftrP26361 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CftrP26361 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CftrP26361 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CftrP26361 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CftrP26361 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CftrP26361 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CftrP26361 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CftrP26361 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CftrP26361 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CftrP26361 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CftrP26361 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CftrP26361 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CftrP26361 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CftrP26361 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CftrP26361 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CftrP26361 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CftrP26361 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CftrP26361 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CftrP26361 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CftrP26361 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CftrP26361 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CftrP26361 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CftrP26361 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CftrP26361 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CftrP26361 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CftrP26361 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CftrP26361 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CftrP26361 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CftrP26361 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CftrP26361 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CftrP26361 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CftrP26361 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CftrP26361 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CftrP26361 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CftrP26361 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CftrP26361 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CftrP26361 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CftrP26361 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CftrP26361 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CftrP26361 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CftrP26361 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CftrP26361 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CftrP26361 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CftrP26361 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CftrP26361 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CftrP26361 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CftrP26361 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CftrP26361 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
CftrP26361 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CftrP26361 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CftrP26361 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CftrP26361 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CftrP26361 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CftrP26361 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CftrP26361 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms