Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms