Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PrkchP23298 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkchP23298 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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