Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PparaP23204 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PparaP23204 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PparaP23204 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PparaP23204 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PparaP23204 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PparaP23204 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PparaP23204 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PparaP23204 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PparaP23204 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PparaP23204 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PparaP23204 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PparaP23204 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PparaP23204 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PparaP23204 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PparaP23204 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PparaP23204 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PparaP23204 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PparaP23204 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PparaP23204 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PparaP23204 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PparaP23204 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PparaP23204 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PparaP23204 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PparaP23204 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PparaP23204 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PparaP23204 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PparaP23204 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PparaP23204 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PparaP23204 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PparaP23204 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PparaP23204 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PparaP23204 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PparaP23204 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PparaP23204 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PparaP23204 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PparaP23204 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PparaP23204 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PparaP23204 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PparaP23204 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PparaP23204 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PparaP23204 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PparaP23204 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PparaP23204 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PparaP23204 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PparaP23204 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PparaP23204 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PparaP23204 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PparaP23204 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PparaP23204 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PparaP23204 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PparaP23204 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PparaP23204 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PparaP23204 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PparaP23204 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PparaP23204 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PparaP23204 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PparaP23204 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PparaP23204 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PparaP23204 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PparaP23204 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PparaP23204 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PparaP23204 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PparaP23204 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms