Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms