Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Amd1P0DMN7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms