Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Egr1P08046 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Egr1P08046 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Egr1P08046 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Egr1P08046 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Egr1P08046 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms