Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06321 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06321 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06321 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06321 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06321 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06321 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06321 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06321 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06321 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06321 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06321 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P06321 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P06321 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06321 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06321 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06321 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06321 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06321 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06321 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06321 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06321 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06321 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06321 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06321 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06321 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06321 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06321 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06321 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06321 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P06321 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06321 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06321 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06321 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms