Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a1P04919 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms