Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GzmbP04187 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GzmbP04187 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms