Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtnd1P03888 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms