Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms