Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01822 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01822 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01822 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01822 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01822 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01822 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01822 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01822 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01822 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01822 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01822 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01822 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01822 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01822 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01822 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01822 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01822 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01822 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01822 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01822 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01822 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01822 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01822 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01822 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01822 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01822 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01822 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01822 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01822 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01822 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01822 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01822 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01822 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01822 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01822 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01822 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01822 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01822 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01822 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01822 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01822 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01822 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01822 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms