Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01638 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01638 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01638 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01638 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01638 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01638 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01638 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01638 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01638 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01638 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01638 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01638 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01638 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01638 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01638 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01638 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01638 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01638 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01638 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01638 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01638 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01638 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01638 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01638 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01638 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01638 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01638 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01638 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01638 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01638 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01638 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01638 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01638 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01638 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01638 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01638 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01638 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms