Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sypl2O89104 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sypl2O89104 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl2O89104 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl2O89104 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl2O89104 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl2O89104 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl2O89104 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl2O89104 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sypl2O89104 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms