Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopeO89079 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopeO89079 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopeO89079 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopeO89079 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopeO89079 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopeO89079 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopeO89079 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopeO89079 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CopeO89079 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopeO89079 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopeO89079 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopeO89079 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopeO89079 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopeO89079 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopeO89079 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopeO89079 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopeO89079 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopeO89079 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopeO89079 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopeO89079 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms