Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F11rO88792 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F11rO88792 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F11rO88792 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F11rO88792 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F11rO88792 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
F11rO88792 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
F11rO88792 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
F11rO88792 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
F11rO88792 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
F11rO88792 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F11rO88792 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F11rO88792 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F11rO88792 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F11rO88792 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms