Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BlmO88700 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BlmO88700 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BlmO88700 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BlmO88700 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BlmO88700 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BlmO88700 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BlmO88700 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BlmO88700 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BlmO88700 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BlmO88700 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BlmO88700 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BlmO88700 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BlmO88700 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BlmO88700 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BlmO88700 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BlmO88700 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BlmO88700 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
BlmO88700 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BlmO88700 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BlmO88700 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BlmO88700 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BlmO88700 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BlmO88700 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BlmO88700 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BlmO88700 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BlmO88700 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BlmO88700 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BlmO88700 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BlmO88700 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BlmO88700 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BlmO88700 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BlmO88700 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BlmO88700 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BlmO88700 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BlmO88700 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BlmO88700 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BlmO88700 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BlmO88700 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BlmO88700 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BlmO88700 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BlmO88700 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BlmO88700 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BlmO88700 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BlmO88700 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BlmO88700 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BlmO88700 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BlmO88700 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BlmO88700 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BlmO88700 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BlmO88700 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BlmO88700 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BlmO88700 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BlmO88700 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BlmO88700 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BlmO88700 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BlmO88700 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BlmO88700 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BlmO88700 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BlmO88700 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BlmO88700 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BlmO88700 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BlmO88700 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BlmO88700 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BlmO88700 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BlmO88700 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BlmO88700 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BlmO88700 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BlmO88700 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
BlmO88700 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BlmO88700 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BlmO88700 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BlmO88700 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BlmO88700 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BlmO88700 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BlmO88700 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BlmO88700 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BlmO88700 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BlmO88700 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BlmO88700 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BlmO88700 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BlmO88700 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BlmO88700 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BlmO88700 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BlmO88700 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms