Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops6O88545 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops6O88545 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops6O88545 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops6O88545 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops6O88545 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops6O88545 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops6O88545 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops6O88545 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops6O88545 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops6O88545 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops6O88545 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops6O88545 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops6O88545 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops6O88545 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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