Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AvilO88398 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AvilO88398 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AvilO88398 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AvilO88398 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AvilO88398 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AvilO88398 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AvilO88398 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AvilO88398 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AvilO88398 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AvilO88398 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AvilO88398 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AvilO88398 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AvilO88398 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AvilO88398 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AvilO88398 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AvilO88398 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AvilO88398 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AvilO88398 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AvilO88398 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AvilO88398 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AvilO88398 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AvilO88398 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AvilO88398 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AvilO88398 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AvilO88398 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AvilO88398 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AvilO88398 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AvilO88398 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AvilO88398 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AvilO88398 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AvilO88398 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AvilO88398 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AvilO88398 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms