Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Lnx1O70263 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lnx1O70263 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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