Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd70O55237 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd70O55237 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd70O55237 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd70O55237 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd70O55237 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd70O55237 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd70O55237 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd70O55237 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd70O55237 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd70O55237 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd70O55237 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd70O55237 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd70O55237 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd70O55237 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd70O55237 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd70O55237 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd70O55237 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd70O55237 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd70O55237 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms