Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlx3O55144 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlx3O55144 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms