Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms