Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxO54751 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxO54751 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxO54751 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxO54751 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxO54751 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxO54751 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxO54751 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxO54751 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxO54751 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxO54751 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxO54751 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxO54751 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxO54751 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxO54751 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrxO54751 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrxO54751 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrxO54751 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrxO54751 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms