Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Klrk1O54709 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Klrk1O54709 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Klrk1O54709 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klrk1O54709 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klrk1O54709 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klrk1O54709 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klrk1O54709 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klrk1O54709 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klrk1O54709 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klrk1O54709 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Klrk1O54709 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klrk1O54709 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klrk1O54709 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klrk1O54709 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klrk1O54709 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Klrk1O54709 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Klrk1O54709 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klrk1O54709 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klrk1O54709 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klrk1O54709 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klrk1O54709 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klrk1O54709 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klrk1O54709 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klrk1O54709 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klrk1O54709 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klrk1O54709 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Klrk1O54709 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klrk1O54709 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klrk1O54709 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klrk1O54709 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klrk1O54709 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klrk1O54709 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Klrk1O54709 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klrk1O54709 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klrk1O54709 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klrk1O54709 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klrk1O54709 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klrk1O54709 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klrk1O54709 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klrk1O54709 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klrk1O54709 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms