Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek2O35942 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek2O35942 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nek2O35942 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms