Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cdk5r2O35926 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdk5r2O35926 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdk5r2O35926 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdk5r2O35926 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdk5r2O35926 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdk5r2O35926 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdk5r2O35926 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdk5r2O35926 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms