Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pik3cdO35904 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms