Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Socs1O35716 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Socs1O35716 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Socs1O35716 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Socs1O35716 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Socs1O35716 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Socs1O35716 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Socs1O35716 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms