Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clk3O35492 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk3O35492 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clk3O35492 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clk3O35492 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clk3O35492 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clk3O35492 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clk3O35492 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms