Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TnxbO35452 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TnxbO35452 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TnxbO35452 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TnxbO35452 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TnxbO35452 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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