Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc1O35379 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc1O35379 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms