Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad6O35182 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Smad6O35182 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad6O35182 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms