Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Polr1aO35134 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr1aO35134 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr1aO35134 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr1aO35134 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Polr1aO35134 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr1aO35134 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr1aO35134 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr1aO35134 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr1aO35134 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Polr1aO35134 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr1aO35134 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Polr1aO35134 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr1aO35134 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Polr1aO35134 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Polr1aO35134 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Polr1aO35134 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Polr1aO35134 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Polr1aO35134 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Polr1aO35134 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Polr1aO35134 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Polr1aO35134 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Polr1aO35134 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Polr1aO35134 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Polr1aO35134 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Polr1aO35134 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Polr1aO35134 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Polr1aO35134 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Polr1aO35134 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms