Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Eftud2O08810 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms