Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dctn1O08788 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn1O08788 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms