Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CckarO08786 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CckarO08786 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CckarO08786 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CckarO08786 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckarO08786 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckarO08786 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckarO08786 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckarO08786 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckarO08786 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckarO08786 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CckarO08786 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckarO08786 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckarO08786 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckarO08786 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckarO08786 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckarO08786 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckarO08786 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckarO08786 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CckarO08786 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CckarO08786 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CckarO08786 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CckarO08786 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CckarO08786 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CckarO08786 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CckarO08786 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms