Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc180J3QNE4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms