Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3336J3QMQ6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Gm3336J3QMQ6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Gm3336J3QMQ6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Gm3336J3QMQ6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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Gm3336J3QMQ6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Gm3336J3QMQ6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Gm3336J3QMQ6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Gm3336J3QMQ6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Gm3336J3QMQ6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3336J3QMQ6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms