Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20834J3QM72 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms