Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21060J3KMU4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21060J3KMU4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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