Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip12G5E870 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms